Atualize a rotina 1097 para uma das versões citadas:
29.0.94.2 29.3.10.2
No menu Ajustes Doc. Fiscais, aba Minas Gerais, foi criado o ajuste 25 - Entradas com IPI destacado na NF-Informativo. Para que esse ajuste seja gerado é necessário que as notas de entrada tenham Vl base IPI;%IPI e Vl IPI maior que zero e que a flag Calc. Cred. IPI esteja desmarcada.