Quando uma determinada filial não aparecer na aba Movimentação de saída/Movimentação de entrada, sub-aba DANF-e da rotina 1452 - Emitir Documento Fiscal Eletrônico, acesse a rotina 132 - Parâmetros da Presidência a partir da versão 21.05.14, parâmetro 2288 - Utilizar NF-e marque a opção Sim. Em seguida clique Salvar e Fechar.