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Passo a passo:

THREAD ERROR ([5668], xxxx_, XXXXXXX) 15/03/2016 16:57:50
Stack :
SX6 not open for GetMV in file c:\bamboo-agent-5.7.2\xml-data\build-dir\totvstec-build131227atfs-windows32\advpl\miscfuncs.inl at line 3408
on SUPERGETMV(MATXFUNA.PRX) 02/04/2015 16:52:00 line : 5267.

O erro exibido durante a execução do compatibilizador, é causado por existir uma empresa ou filial criada que não possui licença de liberação.

Para corrigir, deverá ser avaliada se a empresa ou filial em questão está em uso. Caso esteja é necessário entrar em contato com o CST da TOTVS e solicitar a liberação no sigamat, Se a criação dessa empresa foi indevida, basta excluir do cadastro de empresas e filiais.