O Query Store é uma feature nativa do banco de dados SQL Server disponibilizada a partir do SQL Server 2016; a partir da versão SQL Server 2022, a feature é habilitada por default. 

Basicamente o Query Store (MSSQL Server) fornece insights sobre a escolha e desempenho do plano de consulta para melhor desempenho do SQL Server, ele possui um processo para capturar automaticamente o histórico de consultas, planos e estatísticas em tempo de execução e retém para revisão, conforme documentação Microsoft.

O Query Store, armazena esses dados para que você possa analisar posteriormente cada query, e identificar mudanças no plano de consulta e possíveis melhorias no seu ambiente SQL Server.

Basicamente ele captura automaticamente e armazena durante um período de tempo o histórico de queries, planos de consulta e estatísticas.