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Corrompimento de arquivos 

Embora o SQLITE utilize um arquivo de log transacional interno ( WAL - Write Ahead Log ) e tenha as proteções pertinentes, existem eventos que podem causar corrompimento de partes dos dados (tabelas e índices) gravados em um Database SQLITE, em especial caso ocorram em um momento onde a aplicação está escrevendo/atualizando informações no Database, como por exemplo:

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SL1010: SQLite Error (11) database disk image is malformed on MSUNLOCK(APLIB060.PRW) 16/09/2019 15:15:55 line : 829

Utilitário de linha de comando SQLITE3.EXE

Existem algumas formas de recuperar os dados íntegros de um Database SQLITE. Ambas as formas descritas neste documento utilizam o utilitário de linha de comando oficial do SQLITE – chamado sqlite3.exe – que está disponível para download no site oficial do SQLITE ( https://www.sqlite.org/download.html ) , basta procurar o tópico "Precompiled Binaries for Windows", e localizar o arquivo "sqlite-tools-win%.zip"  – ele contém o utilitário de linha de comando interativo SQLITE3.EXE. Este utilitário também possui build  pré-compilada para Linux, também disponível para download nesta página. Você pode baixar o ZIP contendo as ferramentas e descompactar apenas o "sqlite3" na pasta onde está o Database SQLITE a ser manipulado. 

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echo PRAGMA integrity_check; | sqlite3 SYSTEM_DAMAGED.db
*** in database main ***
On page 827 at right child: Bad ptr map entry key=77441 expected=(5,827) got=(5,68884)
Page 77441: btreeInitPage() returns error code 11
On page 1127 at right child: Bad ptr map entry key=77440 expected=(5,1127) got=(5,76446)
Page 77440: btreeInitPage() returns error code 11
Error: near line 1: database disk image is malformed

Recuperação do

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Database - Exemplo na plataforma WINDOWS 

• Baixe o serviço e/ou feche o TOTVS | Application Server que acessa este Database SQLITE. 
• Siga as instruções de abertura de prompt de comando do tópico "Verificação de Integridade do Database"
• Renomeie o SYSTEM.db corrompido para, por exemplo, SYSTEM_DAMAGED.db
• A partir deste ponto, existem duas formas de recuperação do SYSTEM.db

Alternativa 1:

Execute o comando abaixo do SQLITE. Ele vai criar um clone do Database, criando um novo SYSTEM.db, partindo dos dados que ele conseguir ler do arquivo corrompido SYTEMSYSTEM_DAMAGED.db:

echo .clone SYSTEM.DB | sqlite3 SYSTEM_DAMAGED.db 

Será mostrado na tela o progresso e os objetos lidos e clonados no novo database. Ao final do processo, o novo arquivo SYSTEM.DB estará totalmente íntegro. 

Alternativa 2:

Execute o comando abaixo, ele vai criar um script SQL ( para o SQLLITE ) contendo a criação e alimentação de todos os objetos os dados e objetos do banco corrpompido SYSTEM_DAMAGED.db e criar o arquivo "SYSTEM_RECOVER.sql"

echo .recover | sqlite3 SYSTEM_DAMAGED.db > SYSTEM_RECOVER.sql

Feito isso, agora executamos o comando abaixo, que vai criar um novo database SYSTEM.db, e alimentá-lo com os dados e objetos usando o script do arquivo SYSTEM_RECOVER.sql 

echo. | sqlite3 SYSTEM.db -init SYSTEM_RECOVER.sql